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  • 服务简介:

    (1)Illumina DNA甲基化芯片服务

    目前,人类甲基化芯片研究服务中,增至两款高性价比芯片产品:
    A.?Infinium?HumanMethylation450 BeadChip 经典!(代称“450K”)

    1、450,000多个甲基化位点;覆盖了96%的CpG岛;
    2、Methylation 27 BeadChip的>90%的位点。

    样本数:每张芯片平行检测12个样本

    模板量:1μg

     

    B.Infinium?HumanMethylationEPIC BeadChip New!(代称“850K”)

    1、可检测853,307个CpG位点
    2、特别加强了增强子区以及基因编码区的探针覆盖;
    3、涵盖Infinium Methylation 450 BeadChip芯片中的>90%的内容。

    样本数:每张芯片平行检测8个样本

    模板量:可低至250ng

     

    产品名称

    850 K

    450K

    位点

    1、可检测853,307CpG位点

    2、特别加强了增强子区以及基因编码区的探针覆盖;

    3、涵盖Infinium Methylation 450 BeadChip芯片中的>90%的内容。

    1450,000多个甲基化位点;覆盖了96%CpG岛;

    2Methylation 27 BeadChip>90%的位点。

    样本数

    每张芯片平行检测8个样本

    每张芯片平行检测12个样本

    模板量

    可低至250ng

    1µg

    FFPE样本

    适用

    适用



    2.实验流程:

     

    在亚硫酸氢盐的处理下,没有甲基化的胞嘧啶(C)转化为尿嘧啶(U);甲基化的胞嘧啶则不受影响。

    3.Illumina Human 甲基化芯片的优势:
    A. 覆盖全面;
    B. 无需“甲基化DNA免疫共沉淀”,亚硫酸氢盐处理基因组DNA即可进行芯片实验;
    C. Infinium探针设计,直接识别甲基化位点;
    D. 高技术重复性;

    E. PCR-Free

    F. 适用FFPE样本。



    4.芯片原理(探针设计):

    Illumina Human 甲基化450K芯片采用Illumina BeadArrayTM Infinium技术,特异性的识别甲基化位点。在甲基化450K芯片中,同时采用了Infinium Ⅰ 和Infinium Ⅱ 探针设计,从而使得检测范围最大化。

    (1)Infinium Ⅰ 探针设计  

    对于每个甲基化位点,都对应设计有两种探针:M型磁珠、U型磁珠。M型磁珠尾部为G,用来检测甲基化位点。U型磁珠尾部为A,用来检测未甲基化位点。

    基因组上的某一位点,如果被甲基化了,那么在亚硫酸氢盐的处理下,GC仍为GC,与M型磁珠配对,荧光标记的核苷酸掺入后能被检测到荧光信号。M型磁珠发光。反之,如果没有被甲基化,那么在亚硫酸氢盐的处理下,GC变为GT,与U型磁珠配对,延伸后U型磁珠发光。


    (2)Infinium Ⅱ 探针设计

    Infinium Ⅱ 探针只使用一种磁珠,探针末端为C。配对后只掺入单个碱基( ddNTP-BioT, ddNTP-DNP)。根据荧光类型判断掺入的碱基类型,从而判断是否被甲基化。

    Human甲基化芯片大多数探针都是Infinium Ⅱ 探针。