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高通量基因测序仪
- 制造厂商:Pacific Biosciences 公司
- 购置日期:2015-05-05
- 型号:PacBio RSII
- 生产国别:
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- 功能/应用范围: .未知物种全基因组从头测序
2.已测序物种的基因组重新测序
3.特定目标区域深度测序
4.微生物多样性分析(全长16S rRNA 测序)
5.无需拼接的转录组测序
6.甲基化修饰等表观遗传学研究
7.多重PCR扩增片段测序
- 主要附件: .测序平均读长达3-10kb
2.精确度高(一致性准确度99.99%)
3.速度快(3hr/SMRT cell)、通量高
4.单分子实时测序,无需PCR扩增
5.全基因组拼接简便易行
6.可直接获得碱基修饰信息
7.真正实现全长转录组测序
- 主要技术指标: 测序读长:平均读长 3-12 Kb,最长可达30Kb
2.一致性准确率:一致性准确率可达 99.99%
3.极端GC含量检测能力:无需PCR扩增,适合极端GC含量基因组
4.碱基修饰:可直接读取,并可以检测未知碱基修饰及DNA损伤类型
5.有效数据产量/Cell:0.5-1.2G/Cell
6.输出数据格式和数据兼容性:数据格式和二代兼容
7.软件:smrt analysis提供二级数据分析
- 技术特色: 基因分析技术,整个华东第二台仪器。