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上海交通大学交大

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高通量基因测序仪

  • 制造厂商:Pacific Biosciences 公司
  • 购置日期:2015-05-05
  • 型号:PacBio RSII
  • 生产国别:
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仪器详情
  • 功能/应用范围: .未知物种全基因组从头测序 2.已测序物种的基因组重新测序 3.特定目标区域深度测序 4.微生物多样性分析(全长16S rRNA 测序) 5.无需拼接的转录组测序 6.甲基化修饰等表观遗传学研究 7.多重PCR扩增片段测序
  • 主要附件: .测序平均读长达3-10kb 2.精确度高(一致性准确度99.99%) 3.速度快(3hr/SMRT cell)、通量高 4.单分子实时测序,无需PCR扩增 5.全基因组拼接简便易行 6.可直接获得碱基修饰信息 7.真正实现全长转录组测序
  • 主要技术指标: 测序读长:平均读长 3-12 Kb,最长可达30Kb 2.一致性准确率:一致性准确率可达 99.99% 3.极端GC含量检测能力:无需PCR扩增,适合极端GC含量基因组 4.碱基修饰:可直接读取,并可以检测未知碱基修饰及DNA损伤类型 5.有效数据产量/Cell:0.5-1.2G/Cell 6.输出数据格式和数据兼容性:数据格式和二代兼容 7.软件:smrt analysis提供二级数据分析
  • 技术特色: 基因分析技术,整个华东第二台仪器。